故事发生在名为樱才学院的私立高中。原身为女子学校的樱才学院，迫于男女比例的社会压力，将作为综合学校向社会开放。今年，学校迎来了首批男性学员入学，虽然28:524的男女比例使新入校的男生们感到分外紧张，但作为一所综合性学校，樱才高中崭新的未来开始了。作为二十八分之一，津 田隆利（浅沼晋太郎 配音）以其各方面看来都无比普通的成绩获取了入学资格。在校园中，隆利结识了学生会会长天草筱（日笠阳子 配音），从而开始了自己的学生会生涯。书记七条天空（佐藤聪美 配音）、会计萩村铃（矢作纱友里 配音）、顾问横岛鸣子（小林优 配音）等女性陆续出现在了隆利的身边，而这些外表可爱美艳的女孩们，却都拥有着无论如何都不能用正常来概括的性格，这究竟是怎么回事？

与昔日的同学分别后，主角南云始率领的队伍前往大迷宫获得新的神之魔法。一个突破各种考验，稳步强化回归原始世界的队伍。 然而，在幕后，恶魔们也表现出了令人不安的动作。一个影子潜入王都和一个神秘的人死亡。杀死所有敌人——即使是神明”站在他们面前的真正敌人是谁？！？最强”异世界 奇幻，第二季正式开幕！

1話から16話までのシリーズ前半の話を中心に、30分にストーリーを凝縮。「ワルシャワ・フィルハーモニーオーケストラ」のサウンドに載せて構成。平和だった竜宮島に、突如金色に輝く敵・フェストゥムが出現。「あなたはそこにいますか・・・」の問いかけとともに、人類は戦いの渦に巻き込まれる。フェストゥムを倒すことのできる唯一の力・ファフナーに搭乗して、一騎は戦いを強いられる。戦うことが日常になっていくことに疑問を抱き、島を出て行く一騎。そして、彼の友総士。様々な葛藤を乗り越えて成長していく、主人公たちの姿を鮮やかに描く。

由于阿笠博士家的浴室出了故障，江户川柯南（高山南 配音）随同小兰（山崎和佳奈 配音）、灰原哀（林原惠美 饰）一同去大众浴池洗澡。期间柯南不小心滑倒撞到头部，随后被两名神秘的陌生人带走。一番混乱后，天才诈欺师娜娜（深见梨加 配音）和神秘杀手近藤（香川照之 配音）将失去记忆的柯南带到某处隐蔽的别墅，并伪装成他的父母，而追踪近藤他们的阿笠博士和灰原则遭遇严重车祸。娜娜所属的某个犯罪团伙似乎打算利用制造一起炸弹恐怖袭击。与此同时，供职于某杂志的编辑水岛早苗（广末凉子 配音）怀疑丈夫近藤有外遇，而找到毛利小五郎调查丈夫的行踪。时间流逝，险恶的阴谋浮出水面……本片为《名侦探柯南》漫画连载二十周年的特别企划，编剧请到《盗钥匙的方法》的导演/编剧内田贤治担纲，香川照之、广末凉子受邀为《盗》中自己的角色再度配音。