故事描述在称为布雷斯提尔的世界，名为“吉尔多”的巨大组织独霸了航空技术，企图利用手中强大的科技力量控制世界。这个世界的两大国家安纳托雷和度西斯处于交战状态，为了争夺霸权，两国都委托吉尔多设计空中战舰，并且由吉尔多统一提供引擎。两名拥有一艘Oneship的飞行员克劳斯·沃克和拉维·海特，他们经营空运业务。两人在一次飞行器事故中救了名叫做艾尔维斯·汉密尔顿的少女，并且将她送往空中战舰西耶瓦那，从而卷入到悠关世界存亡的大战中去......

“强殖装甲”是数万年以前降临地球的外星人留下的超生体兵器，平凡的高中生深町晶偶然间得到卡巴，他的同校学长卷岛颚人则得到了另一套。因此成为了秘密组织克诺斯狙击的对象。此后，二人将要面对神秘组织克诺斯所派出兽化兵的追杀。渐渐的，关系到人类起源与未来的秘密变得清晰起来……很久以前，一个名为“后裔”的神秘外星人在地球上留下了三个名为“单位”的物体。高中生深町彰意外获得其中一个，成为“盖弗”，并遭到秘密社团“克罗诺斯”的追捕，该组织计划利用“盖弗”留下的数据来统治世界。后人。与通过被称为“创造”的基因操纵获得了巨大力量的“Zoanoid”怪物展开了激烈的战斗。克洛诺斯执行官生殖体“盖弗二世”的攻击。还有力量远超兽兵的‘超级兽人’。阿基拉虽然处境艰难，但他利用盖弗的能力击退了这些强大的敌人。“盖弗三世”阿基拉和他的朋友们被迫在槙岛津津的帮助下消灭克洛诺斯的日本分支，但他们无力对抗世界级组织克洛诺斯，逐渐被逼入绝境。在与“兽神将军原型”（Proto Zoalord）村上正树以及克洛诺斯内部的反叛分子相遇后，阿基拉和他的朋友们控制了曾经被后裔使用的生物飞船（遗迹飞船）。在。然而，由于由最高级别的预备军“兽王”组成的“克罗诺斯十二将军”的出现，以及总司令阿尔坎菲尔的出现，阿基拉和他的朋友们无奈地被击败。然后，199X年8月17日，由于一场 世界范围的政变的成功，克洛诺斯统治的世界实现了。从那时起已经1年了。阿基拉凭借“巨龙”的强大力量复活，投入了决定人类命运的战斗。敌人和盟友在他周围交叉。阿普托姆是一个“战斗生物”，曾经作为敌人战斗，但背叛了克洛诺斯并站在阿基拉一边。曾经的战友村上，改造后以十二神将之一的身份站在明等人面前。盖弗三世，乔曼，是一个雄心勃勃的人，他从阿基拉那里偷走了泰坦培育装备，并领导自己的军队成为世界的统治者。前兽神将军理查·奎乌的阴谋，野心勃勃，试图造反，但失败，权力被夺走，并被逐出组织。与Gyuoh联手的新出现的第四位性装师Guyver II F以及女性性装师Valkyria。后裔亲手准备的、活了数万年的克罗诺斯领袖兽神将军阿坎菲尔的真实意图是什么？战斗随着每个人的想法而继续。